在这部科幻恐怖惊悚片中，人类的科技水平已经高度发达，克隆人技术和宇宙航行早已实现。通过对许多古老文明的考察与对比，科学家伊丽莎白·肖和查理·赫洛维发现，人类可能是来自一个遥远星系的外星人创造的。在Weyland公司资助下，他们乘坐维克丝所掌管的宇宙飞船普罗米修斯号前往那颗未知的星球。
经过对当地的考察，地球人的设想成功得到印证。可是他们贸然探查“神的秘密”的行为，也将自己引入万劫不复的深渊。
开篇那位吞毒者的身份是什么？
答：他就是赋予人类生命的人类工程师，他喝下的黑色液体使了自己的DNA，与地球上的H2O反应后，生成了大地万物。如果此液体与David（法叔）给Holloway喝的是同一液体，那么这幕也应验了他的那句“Big things have small beginnings”。
大卫为什么要毒害Holloway？
答：首先大卫是机器人，不是人，因此不会干伤天害理之事。他被Programmed为Peter Weyland服务的大卫，在Peter告诉他“try harder”以获得答案时，大卫自然要以“父亲”的命令为先。当Holloway无意间暗示他“我会做任何事情”，大卫就在酒中沾了一滴黑色液体。这不是毒害，而是一个实验。
纳米技术支持的地面显示出一伙Engineers在隧道中奔跑，其中一位头还被掐在门仓另一头，他们逃避何物何事？
答：
a- 有位Engineer兄弟在运输途中不小心接触了黑色液体，被感染变成了某种魔怪。其他兄弟开始逃跑，有位兄弟途中摔倒，最终头颅被斩舱门斩断，被Shaw拾回进行生化模拟。
b- Engineer内讧，当得知先前派去的一位哥未能狠心消灭人类反倒后，大怒领导Engineer准备亲自前往地球毁灭，但少数不同意者企图冲入仓库消灭所有，不幸最终都死去。
c- 一大型变异章鱼追杀Engineer们，使得所有人员遇难，只有一个逃入主机安全睡椅封冻起来。由于章鱼干扰，飞船未能启程。章鱼吃掉一个Engineer后变成最终异形，本片最后五分钟别走开，这个说法能和1979年《异形》圆合。
为什么黑色液体那么不稳定？时而成僵尸（Holloway, Fifield），时而成巨型章鱼（Shaw肚子），时而成无数DNA螺旋體（开篇那哥），而在原液里又犹如山海经南山经中的虎蛟，其状鱼身蛇尾乳白色甚畏？
答：生物学家评论解释这是关于生物变异，我们需要有一个“in the process of changing”的概念直接喝下去与通过子宫母体培育产生不同结果正常，有多种形态很属可理解范围。
为什么Milburn与Fifield决定远离但玩心大起看到黑色液体里浮出的乳白虎蛟？
答：Milburn好奇心作怪也不足为奇；Fifield仍劝告不要多事，但也难逃一劫。
若这艘Engineer飞船是去毁灭人类，那么为何最初又要留给人类地图或邀请函?
答：他们在地球上留下邀请函，但两千年前改变主意决定毁灭人类。这问题也是本片最大疑惑，也是下集预告正如Shaw影片最后所说她想知道他们为什么改变主意?
最后那个唤醒后的哥为啥杀要Shaw?
答：
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